ينبغي النظر في تشخيص داء المثقبيات الأفريقي لدى جميع الأشخاص الذين بقوا في مناطق أفريقية يعتبرون عرضة للمرض.
يصعب تشخيص المرحلة الأولى من مرض النوم ، لأنها تسبب أعراضًا غير محددة ، مثل الحمى والضعف. تتضمن الطرق المستخدمة للتعرف المباشر على التريبانوزومات تحليل عينات مجهرية من الدم (لطخة أو قطرة سميكة) أو من نضح العقدة الليمفاوية. النتائج المخبرية غير النوعية الأخرى تظهر قلة الكريات الشاملة ، وزيادة ESR و PCR ومستويات مرتفعة من IgM.
عندما يغزو الطفيلي الجهاز العصبي المركزي ويبدأ المرضى في إظهار أعراض عصبية ونفسية (ضعف التنسيق الحركي ، والتوهان ، والتشنجات ، واضطرابات النوم) ، يتطلب التشخيص التشخيصي تحليل عينة من السائل الدماغي النخاعي . يسمح فحص الخمر بعزل التريبانوزومات وتسليط الضوء على مستويات عالية من الخلايا الليمفاوية والبروتينات الكلية وزيادة ملحوظة في IgM والخلايا المميزة لـ Mott (خلايا البلازما ذات الفجوات السيتوبلازمية التي تحتوي على الجلوبيولين المناعي).
