لا يزال المصدر الدقيق لفيروس ماربورغ غير معروف. في الوقت الحاضر ، يعتقد أن المرض المسؤول عنه هو مرض حيواني يصيب حيوان واحد أو أكثر من قومه الأصلي في القارة الأفريقية. ومع ذلك ، فإن البحوث التي أجريت حتى الآن لم تسمح بتحديد المستودع الطبيعي للمرض ، على الرغم من أن العديد من الفقاريات والمفصليات تم تحليلها.
ووفقاً لمنظمة الصحة العالمية ، فإن البشر ليسوا جزءًا من الدورة الطبيعية للفيروس ، لذا فإن العدوى تكون أساسًا بسبب الاتصال العرضي مع الرئيسيات المصابة الأخرى. في الواقع ، تم توثيق انتقال العدوى من خلال بعض أنواع القرود ، والتي ربما تعمل "تضخيم الضيوف" لفيروس ماربورغ. وعلاوة على ذلك ، تشير بعض الأدلة إلى أن الرئيسيات يمكن أن تتعرض بدورها للعدوى عن طريق التعرض للخفافيش .
